באפרת קיימים 5 סניפים: 2 סניפי בני עקיבא, עזרא, הצופים הדתיים ואבויויו.
לכל סניף הייחודיות שלו, הסגנון שלו והשכונה שלו.
להיות חלק בתנועה נוער זו מתנה לילד שמאפשרת לו לגדול ולהתפתח, להשתייך, לחייך, ללמוד, להתנדב, לעשות, לתרום, להגשים מטרות וחלומות ולצבור חוויות וערכים שילוו אותו לכל חייו. באפרת אנו משתדלים לתת לכל מדריך את התמיכה, תיווך והכלים שהוא צריך במשך ההדרכה שלו בתנועה. בנוסף אנו עוזרים לצוות של התנועה לחזק ולשמור על החבר'ה שלהם דרך פעילויות  חב"ב, חג"ס ושכב"ג.